Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms