Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFIP2P53365 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms