Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.022e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 VGLL4-204ENST00000417206 581 ntTSL 427.64■■■□□ 2.022e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 VGLL4-207ENST00000419541 466 ntTSL 322.13■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 VGLL4-213ENST00000445411 726 ntTSL 514.98□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.645e-8■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 MNAT1-204ENST00000554002 616 ntTSL 33.84□□□□□ -1.794e-7■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CCDC57-213ENST00000581625 491 ntTSL 524.54■■□□□ 1.521e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CCDC57-212ENST00000578910 796 ntTSL 523.24■■□□□ 1.311e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CLOCK-210ENST00000513033 567 ntTSL 428.59■■■□□ 2.171e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CLOCK-203ENST00000435527 746 ntTSL 328.59■■■□□ 2.171e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 425.32■■□□□ 1.641e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.711e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.419e-7■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 35.19□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 231.19■■■□□ 2.581e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.211e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.651e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 DLEU1-225ENST00000484529 400 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 ZNF266-202ENST00000588221 3503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.531e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.571e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 USP33-216ENST00000530709 549 ntTSL 46.61□□□□□ -1.353e-10■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 416.08■□□□□ 0.165e-7■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.772e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.52e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.962e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 FGF13-206ENST00000448673 652 ntTSL 516.26■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 229.81■■■□□ 2.361e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 326.59■■□□□ 1.851e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.292e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.22e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 23.2
HNRNPMP52272 SMAD3-211ENST00000559460 568 ntTSL 416.06■□□□□ 0.167e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 SHANK2-220ENST00000608988 1879 ntTSL 529.38■■■□□ 2.296e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EMSY-216ENST00000533972 452 ntTSL 312.84□□□□□ -0.353e-15■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EMSY-202ENST00000427574 2415 ntTSL 1 (best)11.7□□□□□ -0.543e-15■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.133e-15■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.273e-15■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.33e-15■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.313e-15■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.383e-15■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.493e-15■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.653e-15■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.127e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.047e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-232ENST00000591579 144 ntTSL 1 (best)21.25■□□□□ 0.997e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.747e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-233ENST00000591989 233 ntTSL 319.62■□□□□ 0.737e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-223ENST00000588516 1304 ntTSL 519.05■□□□□ 0.647e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.477e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.747e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.787e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-211ENST00000585363 241 ntTSL 59.63□□□□□ -0.877e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-236ENST00000592846 484 ntTSL 49.57□□□□□ -0.887e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 NEDD4L-231ENST00000590694 165 ntTSL 56.41□□□□□ -1.387e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.414e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 GIPR-203ENST00000585889 1414 ntTSL 1 (best)29.14■■■□□ 2.264e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.954e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 GIPR-207ENST00000591322 557 ntTSL 426.15■■□□□ 1.784e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.444e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 SSBP3-201ENST00000326956 2913 ntTSL 219.28■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 FARP2-219ENST00000486736 578 ntTSL 320.21■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 FARP2-211ENST00000470617 3273 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EIF4G3-206ENST00000411888 1122 ntTSL 542.42■■■■■ 4.387e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EIF4G3-208ENST00000438975 1270 ntTSL 531.09■■■□□ 2.577e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.157e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.837e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.627e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.077e-8■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 USP10-216ENST00000569511 571 ntTSL 527.56■■■□□ 26e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.811e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.71e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.123e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.351e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 AC118553.2-205ENST00000638779 1983 ntTSL 531.98■■■□□ 2.711e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.651e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 AC118553.2-204ENST00000639040 2568 ntTSL 525.33■■□□□ 1.641e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.641e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 AC118553.2-201ENST00000638968 3175 ntTSL 521.69■■□□□ 1.061e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 AC118553.2-208ENST00000640357 3488 ntTSL 518.72■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 AC118553.2-206ENST00000639171 5352 ntTSL 515.33■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 AC118553.2-207ENST00000640238 2901 ntTSL 510.37□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.32e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ROR2-205ENST00000495386 664 ntTSL 322.19■■□□□ 1.142e-6■■■■□ 23.1
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 280.7 ms