Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPT1P50897 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPT1P50897 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPT1P50897 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPT1P50897 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPT1P50897 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPT1P50897 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPT1P50897 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPT1P50897 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPT1P50897 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPT1P50897 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPT1P50897 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPT1P50897 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPT1P50897 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPT1P50897 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms