Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms