Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTPAP49638 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTPAP49638 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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