Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSR1P43307 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSR1P43307 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSR1P43307 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms