Protein–RNA interactions for Protein: P36873

PPP1CC, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CCP36873 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP1CCP36873 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP1CCP36873 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms