Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFNP31947 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFNP31947 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SFNP31947 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFNP31947 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFNP31947 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFNP31947 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFNP31947 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFNP31947 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFNP31947 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFNP31947 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SFNP31947 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFNP31947 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SFNP31947 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFNP31947 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFNP31947 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFNP31947 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFNP31947 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFNP31947 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms