Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms