Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms