Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms