Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO2P25791 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO2P25791 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO2P25791 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO2P25791 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO2P25791 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO2P25791 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO2P25791 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO2P25791 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO2P25791 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO2P25791 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO2P25791 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO2P25791 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO2P25791 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMO2P25791 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMO2P25791 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMO2P25791 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMO2P25791 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMO2P25791 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms