Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCP20941 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCP20941 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCP20941 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCP20941 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCP20941 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms