Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD58P19256 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD58P19256 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD58P19256 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD58P19256 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD58P19256 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD58P19256 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD58P19256 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD58P19256 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD58P19256 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD58P19256 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD58P19256 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD58P19256 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD58P19256 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD58P19256 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD58P19256 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD58P19256 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD58P19256 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD58P19256 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD58P19256 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD58P19256 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD58P19256 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD58P19256 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms