Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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