Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYL1P12980 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LYL1P12980 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYL1P12980 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms