Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN3P07498 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN3P07498 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms