Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF5BO60841 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF5BO60841 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms