Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSPLO15194 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms