Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELL2O00472 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ELL2O00472 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELL2O00472 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELL2O00472 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL2O00472 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL2O00472 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL2O00472 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL2O00472 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms