Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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