Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms