Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms