Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245452.4-201ENST00000423821 375 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL670729.1-201ENST00000436779 283 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 COX7A1-202ENST00000437291 407 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 Z98747.1-201ENST00000438791 356 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO7L1-201ENST00000442385 328 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121829.1-201ENST00000458368 376 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL55-223ENST00000459783 694 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL754P-201ENST00000470784 266 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL700P-201ENST00000496982 294 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC133435.1-201ENST00000498753 576 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4663-201ENST00000582039 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RPIAP1-201ENST00000587900 742 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.194-201ENST00000612213 283 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6081-201ENST00000613785 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2J3-221ENST00000621093 348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN7-219ENST00000629151 437 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SYN3-202ENST00000358763 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CTCFL-216ENST00000608263 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC15-203ENST00000541184 6012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF197-202ENST00000344387 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AP3B2-201ENST00000261722 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE26-207ENST00000555452 7309 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC144B-208ENST00000618081 8688 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB2-216ENST00000617363 4385 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM214B-201ENST00000322813 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 S100PBP-202ENST00000373475 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PKP1-201ENST00000263946 5447 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K9-204ENST00000554146 2982 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NPY2R-201ENST00000329476 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 VIT-201ENST00000379241 2525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ASIC2-202ENST00000359872 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TYRO3P-201ENST00000558165 2705 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXN4-201ENST00000299162 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SIDT2-202ENST00000324225 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF9-201ENST00000265529 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF11-208ENST00000489689 3320 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAD10-220ENST00000549590 2888 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DEPDC1-201ENST00000370966 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CECR2-201ENST00000262608 4783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L13-216ENST00000616863 4761 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 OTOG-201ENST00000342528 4992 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms