Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 GAGE1-203ENST00000610680 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SPRY4-IT1_1.1-201ENST00000611334 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6831-201ENST00000617240 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC126915.3-201ENST00000620111 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244452.4-201ENST00000637112 283 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073264.4-201ENST00000638055 623 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A4-219ENST00000576616 3768 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-234ENST00000637557 4775 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KBTBD12-203ENST00000405256 5268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CARD8-203ENST00000447740 5210 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359918.1-201ENST00000451892 2720 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GLDCP1-201ENST00000510885 2678 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 C17orf75-201ENST00000225805 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF185-203ENST00000324823 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMPD1-202ENST00000377765 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG1-216ENST00000562631 4042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EGFLAM-202ENST00000336740 3071 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL596202.1-201ENST00000435295 3088 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2T10-202ENST00000642090 3519 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FLII-222ENST00000579294 3936 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7E122P-202ENST00000641144 6171 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 WASHC2A-204ENST00000399339 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A19-210ENST00000580994 1554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC9-229ENST00000622668 4279 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CSGALNACT1-203ENST00000454498 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM7-203ENST00000540163 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5F-201ENST00000361976 5063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNB-AS1-202ENST00000488720 3709 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MRVI1-214ENST00000534266 2824 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCC2-209ENST00000550164 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT172-201ENST00000260570 5415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MGAT5B-203ENST00000428789 4053 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA3E-201ENST00000307792 6476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC5-201ENST00000258821 4779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAS3-203ENST00000408905 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A4-203ENST00000537830 3525 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIA3-209ENST00000622768 5173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN6-202ENST00000346436 5583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SALL1-201ENST00000251020 5146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD1-201ENST00000283309 3067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF780A-206ENST00000595687 3472 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2M4-202ENST00000641868 5934 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRNB1-208ENST00000576360 1837 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TGM4-201ENST00000296125 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011199.1-201ENST00000625022 3362 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms