Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms