Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAB39Q9Y376 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAB39Q9Y376 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms