Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MSRAQ9UJ68 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSRAQ9UJ68 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms