Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms