Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms