Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms