Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms