Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms