Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms