Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTL1Q9NRR1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms