Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INCENPQ9NQS7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INCENPQ9NQS7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms