Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMMDC1Q9NPL8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms