Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms