Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC2Q9BYS8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC2Q9BYS8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC2Q9BYS8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC2Q9BYS8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC2Q9BYS8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC2Q9BYS8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms