Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV5

FSD1, Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSD1Q9BTV5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSD1Q9BTV5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms