Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms