Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms