Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms