Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms