Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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RNF185Q96GF1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RNF185Q96GF1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RNF185Q96GF1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RNF185Q96GF1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RNF185Q96GF1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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