Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms