Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAVIN3Q969G5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CAVIN3Q969G5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms