Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms