Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPC24Q8NBT2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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